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慕柏生物合作研究成果登录国际顶刊《Gut》
慕柏生物客户任志刚博士于2021.03.31在国际知名期刊《Gut》( IF=24.5 )上发表题为"Alterations in the human oral and gut microbiomes and lipidomics in COVID-19"的up-to-date研究成果。
COVID-19在世界范围内迅速传播,导致超过1亿的infect和200万以上的死亡。然而,作为诊断COVID-19的金标准,通过RT-PCR进行核酸检测受到质疑,假阴性率至少为20%。因此,迫切需要寻找一种新的诊断方法。从健康对照(HCs)到COVID-19患者,口腔和粪便微生物多样性降低,从可疑患者(SPs)到确诊患者(CPs)相似。与HCs相比,COVID-19患者的产丁酸细菌减少,而产脂多糖的细菌增加。
通过在随机森林模型上进行五重交叉验证,选择了the best的八个口腔微生物标志物(七个粪便微生物标志物),并基于该the best微生物标志物进行了分类,其曲线下面积(AUC)为98.06%( 粪便微生物组中占99.74%)。
重要的是,口腔微生物标记物已从中国中部和华东地区获得了COVID-19的跨区域验证。口腔和粪便微生物标记物以IgG抗体阳性作为CPs成功诊断出SPs,其AUC为92.11%(粪便微生物组中为98.01%)。口腔微生物群、粪便微生物群和血清脂质分子之间的联系有助于CP的恢复。